Mas de una vez en linux vas a necesitar de pasar todos los archivos a minúsculas, sobretodo sabiendo que desde este sistema operativo los archivos son case sensitive y para evitar problemas, los viejos usuarios no usamos las mayúsculas para nombrar nuestros archivos.
Para esto solo utilizo el siguiente comando el cual me resulta simple:
cd Directorio_a_renombrar_archivos find . -depth | xargs -n 1 rename -v 's/(.*)\/([^\/]*)/$1\/\L$2/' {} \;